沉吟（chén yín）的意思：沉思、凝思；静静地思考。

丛林（cóng lín）的意思：指密集的树木、灌木丛生的地方，也用来比喻纷杂复杂的事物。

登堂（dēng táng）的意思：指爬上高堂，表示得到重视或受到崇敬。

古今（gǔ jīn）的意思：古代与现代，过去与现在

何用（hé yòng）的意思：没有什么用处或者价值。

流憩（liú qì）的意思：停留休息

弭棹（mǐ zhào）的意思：停止划船，停止行动

逝波（shì bō）的意思：逝去的波浪，比喻事物的瞬息即逝或一去不返

石幢（shí chuáng）的意思：指石碑、石柱，也比喻坚定不移的信仰或决心。

枉渚（wǎng zhǔ）的意思：指白白地浪费了时间和精力，没有取得任何实际效果。

往迹（wǎng jì）的意思：指过去的事情或行为留下的痕迹或迹象。

悠悠（yōu yōu）的意思：形容时间长久、漫长。

幽阴（yōu yīn）的意思：指黑暗、阴森、幽深的地方。

阅世（yuè shì）的意思：阅读世间万象，了解人生百态。

遵涂（zūn tú）的意思：遵守规定，依法行事。

这首诗描绘了诗人三次经过本觉寺时所见所感，充满了对历史变迁与时间流逝的感慨。首句“遵涂出枉渚，弭棹攀丛林”描绘了诗人沿着道路前行，穿过曲折的水道，攀爬茂密的丛林，营造了一种探索未知的氛围。接着，“石幢委陈莽，殿壁生幽阴”两句，通过描述古老的石柱被杂草覆盖，殿堂墙壁上长满了阴暗的苔藓，展现了寺庙历经沧桑的景象。

“昔贤此流憩，登堂复沉吟”则表达了前人在此地休息、思考的情景，诗人仿佛能感受到历史人物的足迹和思绪。接下来的“代往迹如扫，声留感弥深”两句，进一步强调了时间的流逝和历史的痕迹，即使过往的一切都被时间抹去，但留下的声音和情感却更加深刻，触动人心。

最后，“悠悠东逝波，阅世成古今”将自然界的流水与人类的历史相联系，暗示着时间的永恒流动，无论古今，都只是时间长河中的不同阶段。“古今既巳尔，何用役吾心”则是诗人对生命与时间的深刻反思，认为面对历史的更迭，个人的情感和忧虑显得微不足道，应该以一种超脱的态度看待世间万物的变化。

整体而言，这首诗通过对自然景观和历史遗迹的描写，表达了诗人对时间、历史和人生哲理的深刻思考，体现了明代文人对于宇宙、人生和自我价值的探索与感悟。