层层（céng céng）的意思：逐层叠加，层层递进

禅房（chán fáng）的意思：指修行禅宗的地方，也可比喻清静幽雅的居所。

节正（jié zhèng）的意思：指遵守节操和正直的品质和行为。

兰若（lán rě）的意思：形容人的品德高尚，具有高洁的气质。

暮霭（mù ǎi）的意思：指夜晚时分的浓厚烟雾或浓重的云雾。

全身（quán shēn）的意思：指整个身体或全身心地投入到某种活动或事情中去。

如在（rú zài）的意思：如同在现场一样，形容描写得非常生动、逼真。

如如（rú rú）的意思：形容事物相似或相同。

色相（sè xiàng）的意思：指人的容貌、气色或事物的色彩、外表。

山林（shān lín）的意思：指山和林木，表示山林之间的景色或山林中的生态环境。

深秋（shēn qiū）的意思：指秋季深入，表示时间已经进入秋季的深处。

时节（shí jié）的意思：指特定的季节或时期，也可指特定的时机。

水石（shuǐ shí）的意思：指关系密切、互相依存的关系。

相如（xiàng rú）的意思：相貌酷似，如出一辙。

依然（yī rán）的意思：仍然如此，依旧不变

这首诗描绘了一座古寺的静谧与庄严。首句“兰若依然水石幽”，以“兰若”代指古寺，点明了古寺所处环境的清幽，水石相映，营造出一种远离尘嚣的氛围。接着，“层层屏嶂俯清流”进一步渲染了古寺周围山水环绕、层次分明的景象，清流潺潺，仿佛是自然界的乐章，为古寺增添了几分灵动。

“苔封古塔全身现，尘闭禅房半偈留”两句，通过“苔封”和“尘闭”这两个细节，生动地展现了古塔和禅房历经岁月洗礼后的沧桑感，同时也暗示了古寺的历史悠久。古塔上的青苔如同岁月的痕迹，禅房中留存的半偈则让人联想到僧侣们曾经的修行生活。

“鸟去山林馀暮霭，客来时节正深秋”描绘了一幅深秋傍晚的景象，山林间鸟儿归巢，暮霭弥漫，而此时正是访客到来的时候。这样的场景不仅增添了季节的特色，也营造了一种静谧而略带寂寥的氛围，让人感受到古寺与自然和谐共存的美好。

最后，“如如色相如如在，重费阇黎苦募脩”表达了对古寺及其历史文化的深刻敬仰。这里的“如如”指的是事物的本质或真实状态，暗示古寺虽历经变迁，但其内在的精神和价值却永恒不变。同时，也体现了对维护和传承古寺文化所付出的艰辛努力的尊重和感慨。

整体而言，这首诗通过对古寺环境、历史、自然景观以及人文情感的细腻描绘，展现了古寺的独特魅力和深厚的文化内涵，是一首富有意境和哲思的作品。