参同（cān tóng）的意思：指心灵相通，思想一致，互相理解、信任并合作的关系。

城里（chéng lǐ）的意思：城市内部；城市中心

故宫（gù gōng）的意思：指位于北京市中心的明清两代的皇宫，是中国古代宫殿建筑之一。

混沌（hùn dùn）的意思：混沌指的是事物杂乱无章、缺乏秩序的状态，也可以表示混乱、困惑或无序的局面。

连昌（lián chāng）的意思：连续兴旺发达，连绵不断。

密荫（mì yīn）的意思：指树木繁茂、荫凉的地方，比喻有权势的人的保护或依赖。

如在（rú zài）的意思：如同在现场一样，形容描写得非常生动、逼真。

生故（shēng gù）的意思：指由于亲人或朋友的死亡而产生的悲伤和痛苦。

所居（suǒ jū）的意思：所居指的是所在的地方，表示人们所居住或所处的环境。

天籁（tiān lài）的意思：指非常美妙动听的声音或音乐。

萧萧（xiāo xiāo）的意思：形容风声、树叶等发出的声音，也可形容草木凋零、寂静无声。

斜日（xié rì）的意思：夕阳斜照的时候，指时间已经过去了大半，暗示事物已经到了结束或衰落的阶段。

雨花（yǔ huā）的意思：指雨中绽放的花朵，比喻在困境中产生的美好事物。

这首诗描绘了一幅宁静而祥和的秋日寺庙生活图景。诗人居住在城中的寺院内，仿佛置身于雨花之中，四周被密密的树荫环绕，阳光斜照，余香随风飘散，营造出一种幽静而又充满生机的氛围。

“密荫迎斜日，馀香散远风。”这两句生动地展现了寺院内的自然景观，阳光透过树叶的缝隙洒下，形成斑驳的光影，而空气中弥漫的香气随着微风轻轻飘散，给读者带来一种清新脱俗的感受。

“上膏窍混沌，天籁契参同。”这里运用了象征手法，将寺院内的静谧与自然界的和谐统一起来，暗示着内心的平静与外界的和谐相融，仿佛达到了一种超然物外的境界。

最后，“犹胜连昌竹，萧萧生故宫。”诗人以连昌宫的衰败景象作对比，表达了对当前生活状态的满足与珍惜。连昌宫曾是繁华之地，如今却只剩下萧瑟的竹林，而自己所在之处虽非繁华，却有着别样的宁静与美好，因此感到更加欣慰与满足。

整体而言，这首诗通过细腻的描写和巧妙的对比，展现了诗人对自然美景的欣赏与对内心平和生活的向往，充满了哲理意味和情感深度。