长叹（cháng tàn）的意思：长时间地叹息、叹气，表示悲伤、失望或无奈的心情。

东林（dōng lín）的意思：指东晋时期桓温、桓玄父子的势力范围，后来泛指权贵集团。

海鳞（hǎi lín）的意思：形容数量众多，密集如鳞片。

何为（hé wéi）的意思：指询问某事物的真正含义或定义。

廓落（kuò luò）的意思：形容事物清晰明了，没有丝毫隐晦或模糊。

落星（luò xīng）的意思：形容事物的光彩消失或失去辉煌。

眇然（miǎo rán）的意思：形容景象模糊、朦胧不清。

南浦（nán pǔ）的意思：指江南地区的温暖和繁荣。也形容地方繁华，人口众多。

秋水（qiū shuǐ）的意思：形容水面清澈透明，如秋天的水。

天一（tiān yī）的意思：指天下第一，最优秀的人或事物。

握中（wò zhōng）的意思：指掌握核心要点，抓住关键问题。

心神（xīn shén）的意思：指心思、精神、思想等。

瑶草（yáo cǎo）的意思：指美丽而稀有的草木。

有秋（yǒu qiū）的意思：指有收获，有所得到。

此诗描绘了一种深夜怀念之情。"东林月未升，廓落星与汉"，通过月亮尚未升起、繁星点缀的景象，营造出一种静谧而寂寞的氛围。"是夕鸿始来，斋中起长叹"则透露出诗人在夜深人静时分，听到天鹅般的行客归来的声音，在室内不禁发出一声长叹，表达了对远方亲友的思念之情。

"怀哉望南浦，眇然夜将半"中，"怀哉"表达了一种深切的怀念，而"望南浦"则是诗人心向往之地。"眇然"形容了夜色朦胧，时间已过半夜，增添了一份寂寞和急迫感。

"但有秋水声，愁使心神乱"表明在这静谧的夜晚，只剩下秋夜里的潺潺流水之声，这声音反而让诗人的思绪更加紊乱，不断地被深切的情愁所困扰。

"握中何为赠，瑶草已衰散"则透露了诗人在手中紧握着一份礼物准备送给某人，但这份礼物——瑶草已经凋零不再美丽，如同诗人的心情一般，充满了无奈和哀愁。

最后两句"海鳞未化时，各在天一岸"则通过海鳞尚未变幻成龙的比喻，以及天边相望而不能相见的情形，表达了诗人与所思之人的距离感，虽然都在同一片天空下，却如同隔着天涯。

总体来看，这首诗是诗人对远方亲友深夜怀念的抒情之作，通过夜景、声响和物象的描写，传达了内心复杂而深沉的情感。